转录辅助因子对不同类型的核心启动子具有专一性

2022-01-10 01:04:25 来源:

基因表达辅助因子（transcriptional cofactor， COF）在增强子与位点密切关系传递调控线索，是基因表达激活和调控的内部效应物。虽然已断定某些COF比其他COF格外偏好某些位点各种类型，但是不尽相同COF对不尽相同位点推断造出的内在甲基化的程度尚不吻合。在一项新的研究者中都，来自奥地利维也纳生物区域内分子医学研究者所的研究者人员在黑腹灵长类S2蛋白质中都使用核酸位点活性校准来筛选23个COF激活7.2万个候选内部位点（core promoter， CP）的能够。关的研究者结果于2019年5同月15日该软件发表在Nature出版物上，论文标题为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些研究者人员观察到内部位点的差异激活，这说明了COF与特定各种类型的内部位点密切关系共存着不尽相同的调节偏好或者说“兼容性（compatibilities）”。这些功能不尽相同的内部位点在TATA盒、下游位点元件（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等已知的序列元件上差异性地石英砂，并在内源性碱基上推断造出不尽相同的染色质特性。值得注意的是，这些内部位点各种类型在它们的H3K4me3和H3K4me1标记上共存不尽相同的比起丰度，这说明了这些脱氧核糖核酸修饰可能能够对应反式调节因子而不是位点和增强子各种类型的顺式调节元件。这些研究者人员断定在人蛋白质和另外两种灵长类蛋白质中都断定了不尽相同COF-内部位点兼容性的共存。为此，他们发现了分别偏好TATA盒和CpG岛位点的COF。COF和内部位点密切关系的不尽相同兼容性能够解释不尽相同的增强子如何甲基化地激活不尽相同组的基因、相同基因内的MA位点（alternative promoter）和相同位点内的不尽相同基因表达起始碱基。综上所述，COF-内部位点兼容性可能是灵长类和人类等不尽相同物种中都不尽相同基因表达程序的基础。独有造原文：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]